Titelaufnahme

Titel
CRISP/Cas9 system II vermittelte Mutagenese von Tet-Proteinen
Weitere Titel
CRISP/CAS9 System II Mediated Mutagenesis of Tet Proteins
VerfasserLindenhofer, Dominik
Erschienen2013
Datum der AbgabeJuli 2013
SpracheEnglisch
DokumenttypBachelorarbeit
Schlagwörter (DE)Epigenetik / 5-Hydroxmethycytosin (5hmC) / Funktion von 5-Hydroxmethycytosin (5hmC) / Tet protein family / Modell-System ohne 5hmC / katalytische Mutanten von Tet1 und Tet2 in Maus ESC / RNA-guided Cas9 system
Schlagwörter (EN)Epigenetics / 5-hydroxmethycytosine (5hmC) / function of 5-hydroxmethycytosine (5hmC) / Tet protein family / model system lacking 5hmC / catalytic mutants of Tet1 and Tet2 of mouse ESC / RNA-guided Cas9 system
Zugriffsbeschränkung
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Klassifikation
Zusammenfassung (Deutsch)

5-Hydroxmethycytosin kann in den meisten differenzierten Geweben nachgewiesen werden, ist jedoch stark verringert in Krebszellen. Die ten-eleven-translocation Protein-Familie (Tet1-3) besitzt die enzymatische Aktivität 5-Methylcytosin (5mC) in 5-Hydroxmethycytosin (5hmC) umzuwandeln und diese sind daher essentiell, um das Zelltyp-spezifische 5hmC-Level zu etablieren und aufrechtzuerhalten. Obwohl großes Interesse daran besteht, die Funktion von 5hmC zu bestimmen, ist es noch nicht gelungen, seine genaue biologische Rolle zu identifizieren. In dieser Arbeit werde ich das RNA guided Cas9 system als Methode vorstellen, um Tet1 und Tet2 mutierte embryonische Stammzellen von Mäusen herzustellen, welchen die katalytische Fähigkeit fehlt 5mC zu 5hmC zu konvertieren. Diese embryonischen Stammzellen könnten möglicherweise ein neues Modell-System zur Untersuchung dieser DNA-Modifikation und dessen Funktion darstellen.

Zusammenfassung (Englisch)

5-hydroxmethycytosine is detectable in most terminally differentiated tissues, but it is depleted in cancer cells. It has been shown that the ten-eleven-translocation protein family (Tet1-3) possesses the enzymatic activity responsible for conversion of 5-methylcytosine (5mC) to 5-hydroxmethycytosine (5hmC), therefore being important to establish and maintain the cell type specific 5hmC levels. Despite the fact that there is a great interest in determining the function of 5hmC, its exact biological role is not yet fully elucidated. In this thesis I present the RNA-guided Cas9 system as a method to create Tet1 and Tet2 mutants of mouse embryonic stem cells which lack the catalytic ability to convert 5mC to 5hmC. These embryonic stem cells might represent a new potential model system to examine the function of this DNA modification.