Titelaufnahme

Titel
Entwicklung eines Programmskripts zur Identifikation von Übereinstimmungen in biologischen Sequenzen
Weitere Titel
Development of a software tool to identify perfect matches in biological sequences
VerfasserKoller, Sabrina
GutachterNuzzo, Angelo ; Graf, Alexandra
Erschienen2016
Datum der AbgabeJuli 2016
SpracheEnglisch
DokumenttypBachelorarbeit
Schlagwörter (DE)Restriktionsenzyme / FASTA / Motiv / Sequenz / Alignment
Schlagwörter (EN)restriction enzyme / FASTA / motif / sequence / alignment
Zugriffsbeschränkung
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Klassifikation
Zusammenfassung (Deutsch)

In dieser Bachelorarbeit wird der Aufbau eines biologischen Programms erläutert. In diesem Programm wird ein FASTA-file, das vom User eingegeben wird auf spezifische, in einem anderen File gespeicherte Sequenzmuster überprüft. Die vorhandenen Motive werden mit der Anzahl der Vorkommnisse und den Positionen in dem DNA Strang in ein Ausgabe File gespeichert. In dieser Arbeit wird auch kurz auf die Themen Restriktionsenzyme, NGS, Mutation, Alignment und FASTA File eingegangen.

Zusammenfassung (Englisch)

In this bachelor thesis the structure of a biological program is described. In this program a FASTA-file, a user input, is tested of specific motifs which are written in another file. The motifs which are in the FASTA-file, the number of occurrences and positions are printed in an output file. In this thesis we shortly explain the topics restriction enzymes, NGS, mutation, alignment and FASTA-file.