Titelaufnahme

Titel
Biopython - Sequenzanalyse
Weitere Titel
Biopython - Sequence objects
VerfasserStauber, Dominik
GutachterNuzzo, Angelo ; Graf, Alexandra
Erschienen2017
Datum der AbgabeJuni 2017
SpracheDeutsch
DokumenttypBachelorarbeit
Schlagwörter (DE)Biopython / Python / Sequenzanalyse / upstream open reading frame / alternative Start / Codon / Gene / Muster
Schlagwörter (EN)Biopython / Python / sequence analysis / upstream open reading frame / alternative start / codon / gene / pattern
Zugriffsbeschränkung
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Klassifikation
Zusammenfassung (Deutsch)

Seitdem die Methoden der DNA Sequenzierung schneller werden, fallen immer größere

Mengen an Daten an, welche analysiert werden müssen. Im Zuge dieser Bachelorarbeit

wurde ein Python-Programm geschrieben um Sequenzen nach Musters, alternativen Start

Codons vor Genen oder Upstream Open Reading Frames abzusuchen. Neben den

Einzelheiten über das Programm und den verwendeten Algorithmus wird auch auf die

dafür benötigten, grundlegendsten biologischen Informationen eingegangen.

Zusammenfassung (Englisch)

DNA sequencing methods generate a lot of data, since they have been getting faster over

the last years. In terms of this thesis, a program has been written with python to handle

some of the obtained data. Within a given sequence, the program can search for a defined

DNA-pattern, check the upstream regions for genes or identify an alternative start codon

followed by a gene. The thesis will cover the basic biological information, the functionality

of the code and a guide on how to use the program.