Bibliographic Metadata

Title
Web-Abfrage
Additional Titles
Web query
AuthorSchöll, Irene
Thesis advisorNuzzo, Angelo ; Tatto, Nadine Elpida
Published2017
Date of SubmissionSeptember 2017
LanguageGerman
Document typeBachelor Thesis
Keywords (DE)World Wide Web / Protein ID / Datenbank / Daten / Information / Python / Abfrage / Protein / PDB / RefSeq / UniProt
Keywords (EN)World Wide Web / Protein ID / Database / Data / Information / Python / Scraping / Protein / PDB / RefSeq / UniProt
Restriction-Information
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Classification
Abstract (German)

Die Hauptaufgabe ist Web-Abfrage via Protein IDs in Datenbanken des World Wide Webs in der Programmiersprache Pyhton. Die Protein Abfrage ist möglich über die manuelle Eingabe oder mit dem Import von einer Datei in ein und demselben Eingabefeld, Eingabe von einer oder mehreren IDs. Das Ergebnis der Website wird in ein Textfile exportiert und kann dort eingesehen werden. Um den Code in einer anderen Computerumgebung auszuführen ist es unerlässlich den Dateipfad im Code für den Import und Export zu adaptieren.

Die Anwendungsschritte sind die Eingabe der Protein ID manuell oder mit Import der Textdatei, eine oder mehrere IDs. Die Auswahl der Datenbank mit dem Klick der Checkbox ist der nächste Schritt. Um die Abfrage und den Export des Ergebnisses zu starten muss die Such oder Export Taste gedrückt werden. Das Ergebnis kann in der Textdatei gefunden werden.

Abstract (English)

The main topic for the implementation with Python is web-scraping via Protein IDs on Databases in the world wide web. To start the query an interface is implemented. It is possible to type the Protein IDs manual or import from a file in the same entry, one or more IDs. The result of the website is written into a text file. Carrying out the code at other computer surrounding it is vital to adapt the path to the file depots for the import and export in the code.

The steps for the user are providing Protein ID manual or via text file import, one or more IDs. The next step is to select the database with the wished database. Starting the query and export the result you click search and export button at least. The result can be found in a text-file.